Hijo natural del papa Alejandro VI, fue nombrado arzobispo de Valencia (1492) y más tarde cardenal (1493). Abandonó el estado eclesiástico, obtuvo del rey de Francia el ducado de Valentinois y casó con Carlota de Albret (1499). Con su ejército conquistó la Romaña, territorio pontificio que estaba en poder de los grandes señores italianos. Pero su autoridad desapareció al subir al trono papal Julio II, enemigo de los Borja; perseguido, huyó a Nápoles y después a Navarra, donde murió en combate
(Lucrecia Borja, duquesa de Ferrara; Roma, 1480-Ferrara, 1519) Hermana de César Borja. Su padre, el pontífice Alejandro VI, que la utilizó para sus fines políticos, la casó primero con Juan Sforza (1492) y después, anulado ese matrimonio, con Alfonso de Aragón (1498). Asesinado este último por orden de César Borja, contrajo nuevo matrimonio con Alfonso de Este, duque de Ferrara (1501). Se encargó del gobierno del ducado a partir de 1505 y su corte se distinguió por las reuniones literarias y artísticas